Etude de la co-circulation des virus Grippaux et SARSCoV-2 dans les sites sentinelles d’Infection Respiratoire Aigüe Sévère de la Grippe en République de Guinée (2023-2024)

Mamadou Bhoye Keita; Mamadou Aliou Sampou; Abdoulaye Oury Barry; Mamoudou Conde; Pierre Felano; Mafoudia Soumare; Bassala Traore; Pepe Tohonamou; Kaba Kourouma; Fodé Amara Traore

doi:10.19044/esj.2025.v21n18p152

Mamadou Bhoye Keita Laboratoire des Virus Respiratoires, Institut National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée. Laboratoire de Biologie Moléculaire, Département de Biologie, Faculté des Sciences, Université Gamal Abdel Nasser de Conakry, Conakry, République de Guinée
Mamadou Aliou Sampou Laboratoire des Virus Respiratoires, Institut National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée. Laboratoire Pluridisciplinaire, Département de Biologie, Faculté des Sciences et Techniques, Université de N’Zérékoré, N’Zérékoré, République de Guinée. Unité de Recherche et de Formation BioHafia, Département de Biologie Appliquée, Faculté des Sciences et Techniques, Université de Labé, Labé, République de Guinée
Abdoulaye Oury Barry Unité de Recherche et Formation BioHafia, Département de Biologie Appliquée, Faculté des Sciences et Techniques, Université de Labé, Labé, République de Guinée
Mamoudou Conde Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée
Pierre Felano Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée
Mafoudia Soumare Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée
Bassala Traore Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée
Pepe Tohonamou Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée
Kaba Kourouma Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée
Fodé Amara Traore Le Laboratoire des Virus Respiratoires, Institution National de Santé Publique, Conakry, République de Guinée

DOI: https://doi.org/10.19044/esj.2025.v21n18p152

Keywords: Covid-19, Grippe, Co-circulation, Site Sentinelle, Infection Respiratoire Aiguës sévères (IRAS)

Abstract

Cette étude transversale, menée du 23 juillet 2023 au 23 juillet 2024, a évalué la co-circulation des virus grippaux et du SARS-CoV-2 dans les sites sentinelles d'Infections Respiratoires Aigües Sévères (IRAS) en Guinée. Sur 639 patients inclus, 8,29 % (53 patients) étaient positifs aux virus recherchés, avec une dominance des virus grippaux (66,03 %) par rapport au SARS-CoV-2 (33,96 %). Parmi les virus grippaux, les sous-types H3N2 (77,77 % des cas de grippe A) et B Victoria (100 % des cas de grippe B) étaient les plus fréquents. La tranche d'âge de 0-2 ans était la plus touchée (54,30 % des cas), suivie des 15-50 ans (18,78 %). Aucune différence significative n'a été observée entre les sexes ou les issues d'hospitalisation. Les résultats ont révélé des périodes distinctes de circulation virale : le SARS-CoV-2 était présent presque toute l'année avec un pic en décembre 2023, tandis que les virus grippaux circulaient principalement durant les saisons pluvieuses. Des co-circulations simultanées des virus grippaux et du SARS-CoV-2 ont été documentées, notamment en juillet, septembre et décembre 2023. Le site de Maférinyah a enregistré le taux de positivité le plus élevé (15,57 %), contre 5,56 % à Ignace Deen. Cette étude confirme la persistance du SARS-CoV-2 et sa co-circulation avec les virus grippaux en Guinée, soulignant l'importance d'une surveillance intégrée pour anticiper les risques épidémiques et guider les politiques de santé publique. Les enfants de moins de 2 ans restent particulièrement vulnérables, justifiant des mesures préventives ciblées.

This cross-sectional study, conducted from 23 July 2023 to 23 July 2024, assessed the co-circulation of influenza viruses and SARS-CoV-2 at sentinel sites for Severe Acute Respiratory Infections (SARI) in Guinea. Among the 639 patients included, 8.29% (53 patients) tested positive for respiratory viruses, with a predominance of influenza viruses (66.03%) compared to SARS-CoV-2 (33.96%). Among the influenza viruses, the H3N2 subtype accounted for 77.77% of influenza A cases, and the B Victoria lineage accounted for 100% of influenza B cases. The 0–2-year-old age group was the most affected (54.30% of cases), followed by the 15–50 age group (18.78%). No significant differences were observed between sexes or in hospitalization outcomes. The results revealed distinct periods of viral circulation: SARS-CoV-2 was present nearly year-round, peaking in December 2023, while influenza viruses mainly circulated during the rainy seasons. Simultaneous co-circulation of influenza viruses and SARS-CoV-2 was documented, notably in July, September, and December 2023. The Maférinyah site recorded the highest positivity rate (15.57%), compared to 5.56% at Ignace Deen. This study confirms the ongoing circulation of SARS-CoV-2 and its co-circulation with influenza viruses in Guinea, highlighting the importance of integrated surveillance to anticipate epidemic risks and inform public health policies. Children under the age of 2 remain particularly vulnerable, justifying targeted preventive measures.

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